简答：红外线的热力学效应可杀死有害细菌，不能杀死顽强的病毒。紫外线的生物学效应可杀死所有微生物。各有优点与实用范围。
为不失一般性，本文先讲杀菌与消毒，再讲杀菌技术：微波杀菌、红外杀菌、紫外杀菌。
注意：人们经常把杀菌与消毒混为一谈，严格讲，杀菌的菌是细菌，消毒的毒是病毒。
读者记住“微波·红外·紫歪”的有关功能与特性参数，有利于提升卫生素质与生活质量。
杀菌与消毒的区别
杀菌，sterilization，特指杀死有害细菌包括致病菌，但不能杀死病毒。杀菌效果，取决于杀菌温度(T)与保温时间(t)两指标。
▲形形色色的细菌，尺度大约在微米级。
有害细菌的敏感温度在50℃左右。常见温时控制：60℃保温30分钟，70℃保温15分钟，80℃保温5分钟，100℃保温1分钟。
消毒，disinfect，指用超高温(约120℃)或超高频消灭病毒的生命力，包括杀死其它微生物。
▲病毒，尺度约1纳米，是最小最顽强的生命体
水的热比容最大，是消毒的最佳介质。非密封容器沸腾不超过100℃，采用高压锅温度达到120℃左右保温2秒，才可以实现消毒效力。也可以采用特定频段的紫外线实施消毒。
微波·红外线·紫外线的特征参数
微波·红外线·紫外线——三姐妹与我们的日常生活息息相关。有必要搞清特性参数。
●可见光，是肉眼可感觉的电磁波。可见光从蓝到红，波段为380nm~780nm。
●紫外线，是波段200~400nm的电磁波。高频240~280nm用于消毒，大气层日光7%的紫外线低频287~390nm可灼伤但不能消毒。
●微波，或雷达波，是波段0.1mm~1m的电磁波。微波可分四个典型的分波段：米波、厘米波、毫米波、丝米波。
▲工业微波干燥杀菌设备
微波的杀菌原理
●热辐射效应。微波炉电磁场变化速度每秒24.5亿次或频率为2450MHz，作用于食物水分子等极性分子，使之震荡24.5亿次/秒而产生高温。
●生物效应，由于微生物细胞液吸收微波的能力优先于其它介质，在微波电磁场中的细胞将迅速破裂而导致菌体细胞死亡。
●反射性，利用微波碰到金属会被反射回来，采用经特殊处理的钢板制成内壁，使微波来回穿透食物，加强热效率。炉内不得使用金属容器，否则影响加热时间，引起炉内放电打火。
●穿透性。微波对一般的陶瓷器、玻璃、耐热塑胶、木器、竹器等具有穿透作用，故为微波烹调用的最佳器皿。
●吸收性。食物皆可吸收微波，使水分子经过振荡摩擦而产生热能。对食物的渗透程度视其质与量的大小等因素而有所不同。
红外线的杀菌原理
红外线，也叫热射线，是介于微波与可见光之间的电磁波，波段1mm~760nm。
根据原子光谱，物质都可产生红外线，分类：近红外与远红外。太阳能通过红外线传播。
▲至高频微波，也叫远红外、低频红外线。
由于远红外也叫高频微波，所以，红外线杀菌原理，可以参考微波杀菌原理。
▲微波红外高频烘烤杀菌设备
紫外线的杀菌原理
只有240~280nm用于消毒：破坏细菌与病毒中的脱氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)的分子结构，造成生长性与再生性细胞死亡。
其253.7nm杀菌最强，DNA与RNA吸收光谱240~280nm，吸收峰在260nm。
紫外线改变细胞遗传与转录，破坏蛋白质合成与复制。紫外线287~390nm不能消毒。
光敏患者，接触紫外线后发生急性光敏反应，摄食大量光敏性食物，其光敏成分与细胞中受体结合，会致严重的光毒性反应。
日光紫外线占比约7%，其中95%是UVA(高频)，5%是UVB(低频)。UVA穿透性很强，穿透薄衣与玻璃，造成伤害较深。UVB接近紫光，一层玻璃即可阻隔。
▲紫外线杀菌消毒装置的一种类型
结语
红外线(低频段)杀菌，具有高温长时的杀伤力，可类比常压杀菌。紫外线(高频段)杀菌，具有高频短时间的杀伤力，可类比高压消毒。
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首先题主的问题有问题，这两个根本没法比较，因为红外线根本就没有杀菌能力，紫外线才具备杀菌能力，生活中晒太阳杀菌是靠阳光中的紫外线的。
红外线是波长介于微波与可见光之间的电磁波，波长在1mm到760纳米（nm）之间，比红光长的非可见光。高于绝对零度的物质都可以产生红外线。现代物理学称之为热射线。意思就是所以生物都能发出红外线，细菌也可以，所以红外线根本不具备杀菌能力。
紫外线是一种电磁波，波长小于可见光，大部分地球表面的紫外线来自太阳，紫外线是伤害性光线的一种，经由皮肤的吸收，会伤害DNA。紫外线杀菌原理是细菌吸收紫外线后，引起DNA链断裂，造成核酸和蛋白的交联破裂，杀灭核酸的生物活性，致细菌死亡。
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